Trong đó, trách nhiệm của người đứng đầu cấp ủy cũng rất lớn. Những vụ việc được lột trần thường do trong tổ chức xảy ra mâu thuẫn nội bộ, đối kháng về lợi ích, nên tố giác lẫn nhau hoặc do dân chúng cáo giác, báo chí đề đạt. Nguyên nhân được nhận định là cơ chế phát hiện sai phạm trong tổ chức Đảng còn mang tính khép kín. Để đẩy mạnh công tác phòng, chống tham nhũng, các cấp ủy cần nêu cao ý thức tự giác, chủ động đương đầu ngay trong nội bộ, đồng nghĩa với việc phải tăng cường công tác rà, giám sát hơn nữa.
Ít khi có những vụ việc được phanh phui nhờ kết quả công tác tự kiểm tra, giám sát trong nội bộ. Điều này cho thấy công tác soát, giám sát trong tổ chức Đảng còn hạn chế.
Cục Cảnh sát điều tra tội nhân về tham nhũng của Bộ Công an mới đây cũng cho biết, rất ít đơn vị phê chuẩn công tác kiểm tra việc chấp hành luật pháp của cơ quan, tổ chức, đơn vị, cá nhân chủ nghĩa thuộc khuôn khổ mình quản lý hoặc tự kiểm tra mà phát hiện ra tù hãm tham nhũng chuyển cơ quan điều tra.
Có trường hợp vì sợ bị cấp trên kỷ luật (theo quy định, để xảy ra tham nhũng, người đứng đầu sẽ phải chịu bổn phận), người đứng đầu tìm cách bưng bít thông tin, lánh né xử lý để giữ thành tích… Tóm lại, có nhiều lý do khiến cho công tác kiểm tra, giám sát của các tổ chức cơ sở Đảng chưa phát huy tác dụng. Ngoài ra, cấp ủy và Ủy ban thẩm tra cấp ủy cấp trên cũng cần sát hơn nữa trong việc rà soát tổ chức đảng cấp dưới thực hành nhiệm vụ soát, giám sát; kịp thời chấn chỉnh tình trạng buông lỏng vai trò lãnh đạo, đặc biệt là thả lỏng công tác thẩm tra, giám sát.
Vắng tình hình công tác phòng, chống tham nhũng 6 tháng đầu năm 2013 của tỉnh thành Hà Nội phản chiếu: Tính đương đầu của một bộ phận cán bộ, đảng viên còn thấp, ít vụ việc tham nhũng được phát hiện qua rà soát nội bộ.
Khi phát hiện sai phạm, có trường hợp xử lý thiếu nghiêm khắc, "dĩ hòa vi quý".
